CBN05172 (Caenorhabditis brenneri)
C2H2 ZF

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source Animal TF db
PF00096 (zf-C2H2) IPR007087 CBN05172 T082984_2.00 Ensembl (2018-Dec-8) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score
DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score
DBD
Identity
slr-2
M00634_2.00
Caenorhabditis elegans
RACTRCAA

TTGYAGTY
PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10040
0.806 0.935
For this family, TFs with SR scores > 0.755 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
CBN05172 C2H2 ZF 48 70
CBN05172 C2H2 ZF 76 99
CBN05172 C2H2 ZF 107 130
CBN05172 C2H2 ZF 137 161

Links

Other C2H2 ZF family TFs
Other Caenorhabditis brenneri TFs

1 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score
Action
ANCCEY_07914 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_07914 I 0.000
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I 0.000
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I 0.000
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I 0.000
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I 0.000
nhr-218 Caenorhabditis elegans WBGene00011750 I 0.000
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D 0.000
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D 0.000
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I 0.000
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I 0.000
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I 0.000
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I 0.000
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I 0.000
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I 0.000
NBR_0001834701 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834701 I 0.000
NBR_0001834801 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834801 I 0.000
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I 0.000
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.000
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.000
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.000
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I 0.000
L596_g14580 Steinernema carpocapsae L596_g14580 N 0.000
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.000
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.000
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.000
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.000
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.000
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.000
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.000
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.000
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.000
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.000
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.000
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.000
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.000
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.000
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I 0.000
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.000
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.000
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.000
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.000
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.000
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.000
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.000
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.000
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.000
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.000
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.000
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.000
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I 0.000
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.000
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.000
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.000
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.000
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.000
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.000
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.000
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.000
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I 0.000
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.000
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.000
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.000
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.000
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.000