ZNF460 (Callithrix jacchus)
C2H2 ZF

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source Animal TF db
PF00096 (zf-C2H2) IPR007087 ENSCJAG00000000026 T089162_2.00 Ensembl (2018-Dec-8) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
ZNF460
M04627_2.00 		Homo sapiens
CAACGCCCCCCGN
NCGGGGGGCGTTG		 SELEX
Yin et al.(2017)
ZNF460_eDBD_HT-SELEX 		0.807 0.976
ZNF543
M08347_2.00 		Homo sapiens
SSVCWGGVCMGS
SCKGBCCWGBSS		 ChIP-seq
Schmitges et al.(2016)
Q08ER8_4-7.RCADE 		0.785 0.940
ZNF547
M08315_2.00 		Homo sapiens
GCYTGCWGMRTTWGC
GCWAAYKCWGCARGC		 ChIP-seq
Schmitges et al.(2016)
Q8IVP9_6-10.RCADE 		0.778 0.952
ZNF460
M07727_2.00 		Homo sapiens
SSCCDCCKCCCS
SGGGMGGHGGSS		 ChIP-seq+ChIP-exo
Barazandeh et al.(2018)
ZNF460.RCADE.ReprocessedData 		0.807 0.976
ZNF543
M07652_2.00 		Homo sapiens
SGBCCCCKCCNS
SNGGMGGGGVCS		 ChIP-seq+ChIP-exo
Barazandeh et al.(2018)
ZNF543.RCADE.ReprocessedData 		0.785 0.940
ZNF547
M07600_2.00 		Homo sapiens
GCATTAGC
GCTAATGC		 ChIP-seq+ChIP-exo
Barazandeh et al.(2018)
ZNF547.MEME.OriginalMapping 		0.778 0.952
ZNF460
M04628_2.00 		Homo sapiens
NNMCBCCCCCCVN
NBGGGGGGVGKNN		 SELEX
Yin et al.(2017)
ZNF460_eDBD_Methyl-HT-SELEX 		0.807 0.976
ZNF547
M08899_2.00 		Homo sapiens
GYNYGYYTGYDGMRTTWGCW
WGCWAAYKCHRCARRCRNRC		 Misc
Kulakovskiy et al.(2013)
ZN547_HUMAN.H11MO.0.C 		0.778 0.952
For this family, TFs with SR scores > 0.755 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 155 177
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 183 205
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 211 233
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 239 261
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 267 289
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 295 317
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 323 345
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 351 373
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 379 401
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 407 429
ENSCJAP00000000035 C2H2 ZF 435 457
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 194 216
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 222 244
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 250 272
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 278 300
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 306 328
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 334 356
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 362 384
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 390 412
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 418 440
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 446 468
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 474 496
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 502 524
ENSCJAP00000000037 C2H2 ZF 530 552
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 5 27
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 33 55
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 61 83
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 89 111
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 117 139
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 145 167
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 173 195
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 201 223
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 229 251
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 257 279
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 285 307
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 313 335
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 341 363
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 369 391
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 397 419
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 425 447
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 453 475
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 481 503
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 509 531
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 537 559
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 565 587
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 593 615
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 621 643
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 652 672
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 678 700
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 706 728
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 734 756
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 762 784
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 790 812
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 818 840
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 846 868
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 874 896
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 902 924
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 930 952
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 958 980
ENSCJAP00000000040 C2H2 ZF 986 1008
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 156 178
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 184 206
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 212 234
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 240 262
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 268 290
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 296 318
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 324 346
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 352 374
ENSCJAP00000000042 C2H2 ZF 378 400
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 196 218
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 224 246
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 252 274
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 280 302
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 308 330
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 336 358
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 364 386
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 392 414
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 420 443
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 449 471
ENSCJAP00000000083 C2H2 ZF 477 499
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 196 218
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 224 246
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 252 274
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 280 302
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 308 330
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 336 358
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 364 386
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 392 414
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 420 442
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 448 470
ENSCJAP00000048682 C2H2 ZF 476 498

Links

Other C2H2 ZF family TFs
Other Callithrix jacchus TFs

26 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
ENSCSAG00000001644 Chlorocebus sabaeus ENSCSAG00000001644 I 0.812
ZNF543 Macaca mulatta ENSMMUG00000019286 I 0.811
ENSP00000322545 Macaca fascicularis ENSP00000322545 I 0.811
ENSNLEG00000010929 Nomascus leucogenys ENSNLEG00000010929 I 0.808
ZNF543 Pan troglodytes ENSPTRG00000011549 I 0.808
ZNF543 Gorilla gorilla ENSGGOG00000009753 I 0.808
ENSPANG00000019732 Papio anubis ENSPANG00000019732 I 0.807
ZNF460 Pan troglodytes ENSPTRG00000011548 I 0.807
ENSP00000353491 Macaca fascicularis ENSP00000353491 I 0.807
ENSPPYG00000010461 Pongo abelii ENSPPYG00000010461 I 0.807
ENSNLEG00000010925 Nomascus leucogenys ENSNLEG00000010925 I 0.807
ZNF460 Macaca mulatta ENSMMUG00000019285 I 0.807
ZNF460 Homo sapiens ENSG00000197714 D 0.807
ENSCSAG00000001646 Chlorocebus sabaeus ENSCSAG00000001646 I 0.807
ENSPANG00000001783 Papio anubis ENSPANG00000001783 I 0.801
ZNF543 Homo sapiens ENSG00000178229 D 0.785
ZNF547 Pan troglodytes ENSPTRG00000011551 I 0.783
ENSCSAG00000001641 Chlorocebus sabaeus ENSCSAG00000001641 I 0.782
ENSNLEG00000010951 Nomascus leucogenys ENSNLEG00000010951 I 0.782
ZNF547 Homo sapiens ENSG00000152433 D 0.778
ZNF547 Gorilla gorilla ENSGGOG00000025938 I 0.778
ENSPANG00000010088 Papio anubis ENSPANG00000010088 I 0.775
ENSP00000282282 Macaca fascicularis ENSP00000282282 I 0.773
ENSMMUG00000014280 Macaca mulatta ENSMMUG00000014280 I 0.771
ZNF547 Otolemur garnettii ENSOGAG00000014442 I 0.761