Ciclev10012016m.g (Citrus clementina)
C2H2 ZF

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00096 (zf-C2H2) IPR007087 Ciclev10012016m.g T142772_2.00 JGI:Phytozome (2018-Apr-12)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
Ciclev10012016m C2H2 ZF 25 48
Ciclev10012016m C2H2 ZF 66 89
Ciclev10012016m C2H2 ZF 95 119
Ciclev10012016m C2H2 ZF 124 150
Ciclev10012016m C2H2 ZF 164 188
Ciclev10012016m C2H2 ZF 197 221
Ciclev10012016m C2H2 ZF 254 279
Ciclev10012323m C2H2 ZF 29 53
Ciclev10012323m C2H2 ZF 58 84
Ciclev10012323m C2H2 ZF 98 122
Ciclev10012323m C2H2 ZF 131 155
Ciclev10012323m C2H2 ZF 188 213
Ciclev10012380m C2H2 ZF 16 40
Ciclev10012380m C2H2 ZF 45 71
Ciclev10012380m C2H2 ZF 85 109
Ciclev10012380m C2H2 ZF 118 142
Ciclev10012380m C2H2 ZF 175 200
Ciclev10012412m C2H2 ZF 10 34
Ciclev10012412m C2H2 ZF 39 65
Ciclev10012412m C2H2 ZF 79 103
Ciclev10012412m C2H2 ZF 112 136
Ciclev10012412m C2H2 ZF 169 194
Ciclev10012446m C2H2 ZF 25 48
Ciclev10012446m C2H2 ZF 66 89
Ciclev10012446m C2H2 ZF 95 119
Ciclev10012446m C2H2 ZF 124 150
Ciclev10012446m C2H2 ZF 164 188
Ciclev10012446m C2H2 ZF 197 221
Ciclev10012759m C2H2 ZF 25 48
Ciclev10012759m C2H2 ZF 66 89
Ciclev10012759m C2H2 ZF 95 119
Ciclev10012759m C2H2 ZF 124 150
Ciclev10012759m C2H2 ZF 164 188
Ciclev10012761m C2H2 ZF 25 48
Ciclev10012761m C2H2 ZF 66 89
Ciclev10012761m C2H2 ZF 95 119
Ciclev10012761m C2H2 ZF 124 150
Ciclev10012761m C2H2 ZF 164 188
Ciclev10012773m C2H2 ZF 29 53
Ciclev10012773m C2H2 ZF 58 84
Ciclev10012773m C2H2 ZF 98 122
Ciclev10012773m C2H2 ZF 131 155
Ciclev10012843m C2H2 ZF 16 40
Ciclev10012843m C2H2 ZF 45 71
Ciclev10012843m C2H2 ZF 85 109
Ciclev10012843m C2H2 ZF 118 142

Links

Other C2H2 ZF family TFs
Other Citrus clementina TFs

2 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
orange1.1g048459m.g Citrus sinensis orange1.1g048459m.g N 0.824