L596_g14537 (Steinernema carpocapsae)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L596_g14537 T308933_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-142
M00703_2.00 		Caenorhabditis elegans
RGTCACAR
YTGTGACY		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10714 		0.791 0.543
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L596_g14537.t1 Nuclear receptor 51 121

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema carpocapsae TFs

59 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.984
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.931
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.930
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.906
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.906
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.893
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.883
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.882
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.882
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.879
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.878
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.869
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.869
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.867
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.864
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.862
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.861
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.860
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.860
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.859
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.859
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.857
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.853
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.849
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.846
L898_g32142 Steinernema monticolum L898_g32142 N 0.842
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.841
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.840
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.839
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.837
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.837
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.836
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.835
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.834
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.832
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.832
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.827
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.822
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.821
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.818
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.813
L898_g19013 Steinernema monticolum L898_g19013 N 0.810
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.806
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.805
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.797
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.797
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I 0.796
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I 0.796
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D 0.791
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.790
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.786
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I 0.778
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I 0.778
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I 0.770
L889_g6800 Steinernema feltiae L889_g6800 N 0.759
CRE30948 Caenorhabditis remanei CRE30948 I 0.758
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.757
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.753
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.747