L893_g18993 (Steinernema glaseri)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L893_g18993 T309338_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-232
M00700_2.00 		Caenorhabditis elegans
NNTNTDWYN
NRWHANANN		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10647 		0.861 0.486
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L893_g18993.t1 Nuclear receptor 10 80

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema glaseri TFs

80 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.976
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.951
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.930
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I 0.925
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.920
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.909
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.907
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.906
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I 0.905
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.901
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.895
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.889
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.888
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.886
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.885
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.885
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.880
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.880
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.877
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.876
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.875
CRE30948 Caenorhabditis remanei CRE30948 I 0.870
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.869
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.869
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I 0.869
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I 0.868
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.868
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I 0.868
L898_g32142 Steinernema monticolum L898_g32142 N 0.862
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D 0.861
CBG15881 Caenorhabditis briggsae CBG15881 I 0.861
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.861
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.860
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.858
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.857
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.857
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.854
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.851
CRE05044 Caenorhabditis remanei CRE05044 I 0.850
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I 0.850
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.846
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.843
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.842
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.841
PEQ_0000560101 Parascaris equorum PEQ_0000560101 I 0.828
L892_g2783 Steinernema scapterisci L892_g2783 N 0.828
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.826
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.826
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.825
ANCCEY_07914 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_07914 I 0.823
NBR_0001218401 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001218401 I 0.821
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.820
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.819
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I 0.817
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.815
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.814
HPLM_0000277901 Haemonchus placei HPLM_0000277901 I 0.809
HCOI00483700 Haemonchus contortus HCOI00483700 I 0.809
ANCCEY_13226 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_13226 I 0.809
SVUK_0002058501 Strongylus vulgaris SVUK_0002058501 I 0.806
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.804
L898_g4013 Steinernema monticolum L898_g4013 I 0.803
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.803
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.801
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.799
SVE_1003800 Strongyloides venezuelensis SVE_1003800 N 0.793
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I 0.787
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.784
CBG16982 Caenorhabditis briggsae CBG16982 I 0.784
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.783
L892_g14814 Steinernema scapterisci L892_g14814 N 0.779
BXY_0200500 Bursaphelenchus xylophilus BXY_0200500 N 0.774
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.773
L892_g14830 Steinernema scapterisci L892_g14830 N 0.767
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I 0.765
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I 0.763
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.763
nhr-218 Caenorhabditis elegans WBGene00011750 I 0.762
L893_g18997 Steinernema glaseri L893_g18997 I 0.759
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.755