L898_g12799 (Steinernema monticolum)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L898_g12799 T309424_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-232
M00700_2.00 		Caenorhabditis elegans
NNTNTDWYN
NRWHANANN		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10647 		0.784 0.486
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L898_g12799.t1 Nuclear receptor 9 79

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema monticolum TFs

65 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.976
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.961
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.946
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.944
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.939
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.928
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.919
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.918
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.917
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.914
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.913
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.912
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.910
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.909
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.904
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.903
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.901
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.901
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.900
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.898
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.895
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.893
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.890
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.886
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.882
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.876
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.875
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.874
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.870
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.869
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.868
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.862
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I 0.857
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.856
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.854
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.854
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.850
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.850
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I 0.849
L892_g14814 Steinernema scapterisci L892_g14814 N 0.841
L898_g32142 Steinernema monticolum L898_g32142 N 0.837
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I 0.833
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.829
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.826
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.818
nhr-218 Caenorhabditis elegans WBGene00011750 I 0.817
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I 0.813
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I 0.813
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.811
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.798
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I 0.796
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.794
L898_g19013 Steinernema monticolum L898_g19013 N 0.793
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.788
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.786
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D 0.784
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.774
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.773
NBR_0001834801 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834801 I 0.772
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I 0.771
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I 0.761
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.757
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I 0.756
L898_g12798 Steinernema monticolum L898_g12798 I 0.749
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.746