L898_g19014 (Steinernema monticolum)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L898_g19014 T309449_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-142
M00703_2.00 		Caenorhabditis elegans
RGTCACAR
YTGTGACY		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10714 		0.752 0.529
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L898_g19014.t1 Nuclear receptor 15 85

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema monticolum TFs

57 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.951
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.933
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.930
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.922
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.920
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.919
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.918
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.917
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.911
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.911
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.909
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.907
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.901
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.901
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.901
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.897
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.895
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.892
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.883
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.881
L898_g32142 Steinernema monticolum L898_g32142 N 0.879
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.879
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.873
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.871
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.870
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.865
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.859
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.857
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.856
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.854
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.846
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.837
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.832
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.832
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.827
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.825
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.824
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.822
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.821
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.819
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.819
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.814
L892_g14814 Steinernema scapterisci L892_g14814 N 0.811
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.810
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.804
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.797
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.793
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.792
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I 0.790
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.786
L898_g19013 Steinernema monticolum L898_g19013 N 0.773
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I 0.765
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I 0.765
L889_g6800 Steinernema feltiae L889_g6800 N 0.753
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D 0.752
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I 0.745
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I 0.745