L898_g4012 (Steinernema monticolum)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L898_g4012 T309512_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score
DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score
DBD
Identity
nhr-142
M00703_2.00
Caenorhabditis elegans
RGTCACAR

YTGTGACY
PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10714
0.777 0.582
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L898_g4012.t1 Nuclear receptor 25 92

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema monticolum TFs

53 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score
Action
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.907
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.905
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.902
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.888
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.882
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.880
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.878
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.868
NBR_0001834801 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834801 I 0.867
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.864
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.862
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.860
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.859
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.854
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.853
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.842
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.842
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.833
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.832
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.832
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.832
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.832
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.827
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.826
L898_g4013 Steinernema monticolum L898_g4013 I 0.824
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.822
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.821
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.816
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.815
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.808
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.808
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.808
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.808
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.802
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.797
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.793
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I 0.778
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.777
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I 0.777
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D 0.777
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.774
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.768
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.768
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I 0.763
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I 0.763
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I 0.763
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I 0.763
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I 0.763
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.752
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.752
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.748
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.747
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.746