POPTR_0017s12430 (Populus trichocarpa)
WRKY

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source Animal TF db
PF03106 (WRKY) IPR003657 POPTR_0017s12430 T354419_2.00 Ensembl (2018-Dec-8) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score
DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score
DBD
Identity
WRKY3
M07381_2.00
Arabidopsis thaliana
MAWAGTCAAMR

YKTTGACTWTK
Dap-seq
OMalley et al.(2016)
WRKY3_col_a
0.822 0.736
PK05432.1
M01324_2.00
Cannabis sativa
NNRGTCARH

DYTGACYNN
PBM
Lambert et al.(2019)
pTH11342
0.821 0.747
Q40090_IPOBA
M11466_2.00
Ipomoea batatas Transfac license required
Transfac license required
Transfac
Matys et al.(2006)
P$SPF1_Q2
0.814 0.725
WRKY20
M07414_2.00
Arabidopsis thaliana
HHHRGTCAAMGNH

DNCKTTGACYDDD
Dap-seq
OMalley et al.(2016)
WRKY20_col_a
0.813 0.692
WRKY2
M02567_2.00
Arabidopsis thaliana
BRGTCAAM

KTTGACYV
PBM
Weirauch et al.(2014)
pTH8832
0.809 0.736
WRKY33
M02554_2.00
Arabidopsis thaliana
NNRGTCHDNN

NNHDGACYNN
PBM
Weirauch et al.(2014)
pTH8183
0.808 0.703
WRKY33
M07391_2.00
Arabidopsis thaliana
HWWAGTCAAMD

HKTTGACTWWD
Dap-seq
OMalley et al.(2016)
WRKY33_col_a
0.808 0.703
For this family, TFs with SR scores > 0.808 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
POPTR_0017s12430.1 WRKY 239 295
POPTR_0017s12430.1 WRKY 412 445

Links

Other WRKY family TFs
Other Populus trichocarpa TFs

528 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score
Action
CJA38940 Caenorhabditis japonica CJA38940 N 0.000
CJA37676 Caenorhabditis japonica CJA37676 N 0.000
CJA37630 Caenorhabditis japonica CJA37630 N 0.000
CJA37476 Caenorhabditis japonica CJA37476 N 0.000
CJA37149 Caenorhabditis japonica CJA37149 N 0.000
CJA37126 Caenorhabditis japonica CJA37126 N 0.000
CJA36978 Caenorhabditis japonica CJA36978 N 0.000
CJA36857 Caenorhabditis japonica CJA36857 N 0.000
CJA36855 Caenorhabditis japonica CJA36855 N 0.000
CJA37962 Caenorhabditis japonica CJA37962 N 0.000
CJA38122 Caenorhabditis japonica CJA38122 N 0.000
CJA38934 Caenorhabditis japonica CJA38934 N 0.000
CJA38824 Caenorhabditis japonica CJA38824 N 0.000
CJA38781 Caenorhabditis japonica CJA38781 N 0.000
CJA38513 Caenorhabditis japonica CJA38513 N 0.000
CJA38417 Caenorhabditis japonica CJA38417 N 0.000
CJA38371 Caenorhabditis japonica CJA38371 N 0.000
CJA38161 Caenorhabditis japonica CJA38161 N 0.000
CJA38131 Caenorhabditis japonica CJA38131 N 0.000
CJA36850 Caenorhabditis japonica CJA36850 N 0.000
CJA36771 Caenorhabditis japonica CJA36771 N 0.000
CJA36681 Caenorhabditis japonica CJA36681 N 0.000
CJA35897 Caenorhabditis japonica CJA35897 N 0.000
CJA35832 Caenorhabditis japonica CJA35832 N 0.000
CJA35247 Caenorhabditis japonica CJA35247 N 0.000
CJA35057 Caenorhabditis japonica CJA35057 N 0.000
CJA35049 Caenorhabditis japonica CJA35049 N 0.000
CJA34990 Caenorhabditis japonica CJA34990 N 0.000
CJA34945 Caenorhabditis japonica CJA34945 N 0.000
CJA34889 Caenorhabditis japonica CJA34889 N 0.000
CJA35914 Caenorhabditis japonica CJA35914 N 0.000
CJA35928 Caenorhabditis japonica CJA35928 N 0.000
CJA36536 Caenorhabditis japonica CJA36536 N 0.000
CJA36411 Caenorhabditis japonica CJA36411 N 0.000
CJA36099 Caenorhabditis japonica CJA36099 N 0.000
CJA36035 Caenorhabditis japonica CJA36035 N 0.000
CJA36030 Caenorhabditis japonica CJA36030 N 0.000
CJA35993 Caenorhabditis japonica CJA35993 N 0.000
CJA35992 Caenorhabditis japonica CJA35992 N 0.000
CJA35933 Caenorhabditis japonica CJA35933 N 0.000
CJA34808 Caenorhabditis japonica CJA34808 N 0.000
CJA39094 Caenorhabditis japonica CJA39094 N 0.000
CJA43218 Caenorhabditis japonica CJA43218 N 0.000
CJA41932 Caenorhabditis japonica CJA41932 N 0.000
CJA41836 Caenorhabditis japonica CJA41836 N 0.000
CJA41694 Caenorhabditis japonica CJA41694 N 0.000
CJA41662 Caenorhabditis japonica CJA41662 N 0.000
CJA41556 Caenorhabditis japonica CJA41556 N 0.000
CJA41552 Caenorhabditis japonica CJA41552 N 0.000
CJA41207 Caenorhabditis japonica CJA41207 N 0.000
CJA41154 Caenorhabditis japonica CJA41154 N 0.000
CJA42032 Caenorhabditis japonica CJA42032 N 0.000
CJA42199 Caenorhabditis japonica CJA42199 N 0.000
CJA43076 Caenorhabditis japonica CJA43076 N 0.000
CJA43071 Caenorhabditis japonica CJA43071 N 0.000
CJA43027 Caenorhabditis japonica CJA43027 N 0.000
CJA42880 Caenorhabditis japonica CJA42880 N 0.000
CJA42856 Caenorhabditis japonica CJA42856 N 0.000
CJA42394 Caenorhabditis japonica CJA42394 N 0.000
CJA42323 Caenorhabditis japonica CJA42323 N 0.000
CJA42235 Caenorhabditis japonica CJA42235 N 0.000
CJA41048 Caenorhabditis japonica CJA41048 N 0.000
CJA40904 Caenorhabditis japonica CJA40904 N 0.000
CJA40752 Caenorhabditis japonica CJA40752 N 0.000
CJA39760 Caenorhabditis japonica CJA39760 N 0.000
CJA39630 Caenorhabditis japonica CJA39630 N 0.000
CJA39627 Caenorhabditis japonica CJA39627 N 0.000
CJA39602 Caenorhabditis japonica CJA39602 N 0.000
CJA39508 Caenorhabditis japonica CJA39508 N 0.000
CJA39357 Caenorhabditis japonica CJA39357 N 0.000
CJA39242 Caenorhabditis japonica CJA39242 N 0.000
CJA39167 Caenorhabditis japonica CJA39167 N 0.000
CJA39812 Caenorhabditis japonica CJA39812 N 0.000
CJA39994 Caenorhabditis japonica CJA39994 N 0.000
CJA40694 Caenorhabditis japonica CJA40694 N 0.000
CJA40556 Caenorhabditis japonica CJA40556 N 0.000
CJA40503 Caenorhabditis japonica CJA40503 N 0.000
CJA40419 Caenorhabditis japonica CJA40419 N 0.000
CJA40405 Caenorhabditis japonica CJA40405 N 0.000
CJA40346 Caenorhabditis japonica CJA40346 N 0.000
CJA40300 Caenorhabditis japonica CJA40300 N 0.000
CJA40132 Caenorhabditis japonica CJA40132 N 0.000
CJA39135 Caenorhabditis japonica CJA39135 N 0.000
CJA27756 Caenorhabditis japonica CJA27756 N 0.000
CJA20982 Caenorhabditis japonica CJA20982 N 0.000
CJA18123 Caenorhabditis japonica CJA18123 N 0.000
CJA16335 Caenorhabditis japonica CJA16335 N 0.000
CJA13741 Caenorhabditis japonica CJA13741 N 0.000
CJA12586 Caenorhabditis japonica CJA12586 N 0.000
CJA11720 Caenorhabditis japonica CJA11720 N 0.000
CJA10237 Caenorhabditis japonica CJA10237 N 0.000
CJA09380 Caenorhabditis japonica CJA09380 N 0.000
CJA21062 Caenorhabditis japonica CJA21062 N 0.000
CJA21479 Caenorhabditis japonica CJA21479 N 0.000
CJA26527 Caenorhabditis japonica CJA26527 N 0.000
CJA23952 Caenorhabditis japonica CJA23952 N 0.000
CJA23911 Caenorhabditis japonica CJA23911 N 0.000
CJA23565 Caenorhabditis japonica CJA23565 N 0.000
CJA22727 Caenorhabditis japonica CJA22727 N 0.000
CJA22385 Caenorhabditis japonica CJA22385 N 0.000
CJA22378 Caenorhabditis japonica CJA22378 N 0.000
CJA21617 Caenorhabditis japonica CJA21617 N 0.000
CJA08447 Caenorhabditis japonica CJA08447 N 0.000
CJA07631 Caenorhabditis japonica CJA07631 N 0.000
CJA07083 Caenorhabditis japonica CJA07083 N 0.000
CBG27598 Caenorhabditis briggsae CBG27598 N 0.000
CBG25835 Caenorhabditis briggsae CBG25835 N 0.000
CBG25534 Caenorhabditis briggsae CBG25534 N 0.000
CBG24221 Caenorhabditis briggsae CBG24221 N 0.000
CBG18400 Caenorhabditis briggsae CBG18400 N 0.000
CBG12887 Caenorhabditis briggsae CBG12887 N 0.000
CBG10260 Caenorhabditis briggsae CBG10260 N 0.000
CBG06875 Caenorhabditis briggsae CBG06875 N 0.000
CJA00222 Caenorhabditis japonica CJA00222 N 0.000
CJA01033 Caenorhabditis japonica CJA01033 N 0.000
CJA06389 Caenorhabditis japonica CJA06389 N 0.000
CJA05858 Caenorhabditis japonica CJA05858 N 0.000
CJA05743 Caenorhabditis japonica CJA05743 N 0.000
CJA04206 Caenorhabditis japonica CJA04206 N 0.000
CJA04046 Caenorhabditis japonica CJA04046 N 0.000
CJA03346 Caenorhabditis japonica CJA03346 N 0.000
CJA02629 Caenorhabditis japonica CJA02629 N 0.000
CJA01220 Caenorhabditis japonica CJA01220 N 0.000
CBG05734 Caenorhabditis briggsae CBG05734 N 0.000
CJA28229 Caenorhabditis japonica CJA28229 N 0.000
CJA34672 Caenorhabditis japonica CJA34672 N 0.000
CJA33658 Caenorhabditis japonica CJA33658 N 0.000
CJA33630 Caenorhabditis japonica CJA33630 N 0.000
CJA33459 Caenorhabditis japonica CJA33459 N 0.000
CJA33458 Caenorhabditis japonica CJA33458 N 0.000
CJA33353 Caenorhabditis japonica CJA33353 N 0.000
CJA33310 Caenorhabditis japonica CJA33310 N 0.000
CJA33264 Caenorhabditis japonica CJA33264 N 0.000
CJA33161 Caenorhabditis japonica CJA33161 N 0.000
CJA33671 Caenorhabditis japonica CJA33671 N 0.000
CJA33878 Caenorhabditis japonica CJA33878 N 0.000
CJA34521 Caenorhabditis japonica CJA34521 N 0.000
CJA34486 Caenorhabditis japonica CJA34486 N 0.000
CJA34427 Caenorhabditis japonica CJA34427 N 0.000
CJA34410 Caenorhabditis japonica CJA34410 N 0.000
CJA34355 Caenorhabditis japonica CJA34355 N 0.000
CJA34132 Caenorhabditis japonica CJA34132 N 0.000
CJA34115 Caenorhabditis japonica CJA34115 N 0.000
CJA33928 Caenorhabditis japonica CJA33928 N 0.000
CJA33003 Caenorhabditis japonica CJA33003 N 0.000
CJA32767 Caenorhabditis japonica CJA32767 N 0.000
CJA32765 Caenorhabditis japonica CJA32765 N 0.000
CJA31077 Caenorhabditis japonica CJA31077 N 0.000
CJA31057 Caenorhabditis japonica CJA31057 N 0.000
CJA31027 Caenorhabditis japonica CJA31027 N 0.000
CJA30990 Caenorhabditis japonica CJA30990 N 0.000
CJA30895 Caenorhabditis japonica CJA30895 N 0.000
CJA30706 Caenorhabditis japonica CJA30706 N 0.000
CJA29131 Caenorhabditis japonica CJA29131 N 0.000
CJA28968 Caenorhabditis japonica CJA28968 N 0.000
CJA31121 Caenorhabditis japonica CJA31121 N 0.000
CJA31180 Caenorhabditis japonica CJA31180 N 0.000
CJA32698 Caenorhabditis japonica CJA32698 N 0.000
CJA32590 Caenorhabditis japonica CJA32590 N 0.000
CJA32546 Caenorhabditis japonica CJA32546 N 0.000
CJA32265 Caenorhabditis japonica CJA32265 N 0.000
CJA32188 Caenorhabditis japonica CJA32188 N 0.000
CJA32178 Caenorhabditis japonica CJA32178 N 0.000
CJA31775 Caenorhabditis japonica CJA31775 N 0.000
CJA31183 Caenorhabditis japonica CJA31183 N 0.000
CJA28704 Caenorhabditis japonica CJA28704 N 0.000