Cucsa.012070 (Cucumis sativus)
PLATZ

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF04640 (PLATZ) IPR006734 Cucsa.012070 T315889_2.00 JGI (2012-Mar-17)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
Cucsa.012070.1 PLATZ 67 144

Links

Other PLATZ family TFs
Other Cucumis sativus TFs

25 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D 0.000
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.000
L893_g18997 Steinernema glaseri L893_g18997 I 0.000
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.000
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.000
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I 0.000
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.000
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.000
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.000
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.000
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.000
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.000
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.000
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.000
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I 0.000
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.000
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I 0.000
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.000
L898_g12798 Steinernema monticolum L898_g12798 I 0.000
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.000
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.000
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.000
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.000
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.000
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I 0.000
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.000
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.000
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.000
NBR_0001218401 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001218401 I 0.000
NBR_0001834701 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834701 I 0.000
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I 0.000
SVUK_0002058501 Strongylus vulgaris SVUK_0002058501 I 0.000
nhr-170 Caenorhabditis elegans WBGene00008309 I 0.000
HPLM_0000277901 Haemonchus placei HPLM_0000277901 I 0.000
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I 0.000
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.000
HCOI00483700 Haemonchus contortus HCOI00483700 I 0.000
ANCCEY_13226 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_13226 I 0.000
ACOC_0000492601 Angiostrongylus costaricensis ACOC_0000492601 I 0.000
nhr-178 Caenorhabditis elegans WBGene00017510 I 0.000
nhr-231 Caenorhabditis elegans WBGene00012449 I 0.000
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I 0.000
nhr-54 Caenorhabditis elegans WBGene00003644 I 0.000
CRE30948 Caenorhabditis remanei CRE30948 I 0.000
CRE15675 Caenorhabditis remanei CRE15675 I 0.000
CRE15644 Caenorhabditis remanei CRE15644 I 0.000
CBN23838 Caenorhabditis brenneri CBN23838 I 0.000
CBG22870 Caenorhabditis briggsae CBG22870 I 0.000
CBG20729 Caenorhabditis briggsae CBG20729 I 0.000
CBG20727 Caenorhabditis briggsae CBG20727 I 0.000
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.000
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.000
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.000
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.000
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.000
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I 0.000
L596_g14586 Steinernema carpocapsae L596_g14586 I 0.000
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.000
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.000
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.000
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I 0.000
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.000
L596_g14580 Steinernema carpocapsae L596_g14580 N 0.000
L892_g14834 Steinernema scapterisci L892_g14834 N 0.000
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.000
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.000
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.000
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.000
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.000
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.000
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.000
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.000