BRADI1G47480 (Brachypodium distachyon)
AP2

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source Animal TF db
PF00847 (AP2) IPR001471 BRADI1G47480 T001270_2.00 Ensembl (2018-Dec-8) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
ERF003
M06667_2.00 		Arabidopsis thaliana
DYCDCCRCCGYMDHHDYHN
NDRHDDHKRCGGYGGHGRH		 Dap-seq
OMalley et al.(2016)
ESE3_col_a 		0.852 0.961
ERF003
M06668_2.00 		Arabidopsis thaliana
HDYCKCCGCCGYHDH
DHDRCGGCGGMGRHD		 Dap-seq
OMalley et al.(2016)
ESE3_colamp_a 		0.852 0.961
WIN1
M01603_2.00 		Arabidopsis thaliana
VCRCCGCNNN
NNNGCGGYGB		 PBM
Weirauch et al.(2014)
pTH7566 		0.722 0.804
For this family, TFs with SR scores > 0.677 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
BRADI1G47480.1 AP2 6 57

Links

Other AP2 family TFs
Other Brachypodium distachyon TFs

295 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.000
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.000
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.000
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.000
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.000
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.000
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.000
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.000
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.000
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.000
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.000
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.000
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.000
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.000
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.000
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.000
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.000
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.000
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.000
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.000
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.000
L892_g14816 Steinernema scapterisci L892_g14816 N 0.000
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.000
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.000
L892_g14823 Steinernema scapterisci L892_g14823 N 0.000
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.000
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.000
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.000
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.000
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.000
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.000
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.000
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.000
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.000
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.000
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.000
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.000
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.000
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.000
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.000
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.000
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.000
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.000
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.000
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.000
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.000