GLYMA19G44580 (Glycine max)
AP2

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source Animal TF db
PF00847 (AP2) IPR001471 GLYMA19G44580 T002050_2.00 Ensembl (2018-Dec-8) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
ERF023
M06560_2.00 		Arabidopsis thaliana
DYCACCGACANHDNN
NNHDNTGTCGGTGRH		 Dap-seq
OMalley et al.(2016)
AT1G01250_col_a 		0.801 0.920
ERF023
M06561_2.00 		Arabidopsis thaliana
HHNHHDHCACCGACA
TGTCGGTGDHDDNDD		 Dap-seq
OMalley et al.(2016)
AT1G01250_colamp_a 		0.801 0.920
For this family, TFs with SR scores > 0.677 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
GLYMA19G44580.1 AP2 26 77

Links

Other AP2 family TFs
Other Glycine max TFs

45 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
ANCCEY_07914 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_07914 I 0.000
ANCCEY_13226 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_13226 I 0.000
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I 0.000
CBG15881 Caenorhabditis briggsae CBG15881 I 0.000
CRE05044 Caenorhabditis remanei CRE05044 I 0.000
CRE30948 Caenorhabditis remanei CRE30948 I 0.000
HCOI00483700 Haemonchus contortus HCOI00483700 I 0.000
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I 0.000
HPLM_0000277901 Haemonchus placei HPLM_0000277901 I 0.000
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I 0.000
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.000
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.000
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.000
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.000
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.000
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.000
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I 0.000
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.000
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.000
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.000
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.000
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.000
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.000
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.000
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.000
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.000
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.000
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.000
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.000
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.000
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.000
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.000
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.000
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.000
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.000
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.000
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.000
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.000
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I 0.000
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.000
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.000
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.000
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.000
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.000
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.000
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.000
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.000
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.000
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.000
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.000
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.000
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.000
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.000
L898_g32142 Steinernema monticolum L898_g32142 N 0.000
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.000
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.000
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.000
L898_g4013 Steinernema monticolum L898_g4013 I 0.000
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.000
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.000
NBR_0001218401 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001218401 I 0.000
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D 0.000
PEQ_0000560101 Parascaris equorum PEQ_0000560101 I 0.000
PTRK_0001404900 Parastrongyloides trichosuri PTRK_0001404900 N 0.000
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I 0.000
SVE_1003800 Strongyloides venezuelensis SVE_1003800 N 0.000
SVUK_0002058501 Strongylus vulgaris SVUK_0002058501 I 0.000