e_gw1.8.211.1 (Fragilariopsis cylindrus)
Sox

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00505 (HMG_box) IPR000910 e_gw1.8.211.1 T333980_2.00 JGI (2012-Mar-17)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
e_gw1.8.211.1 Sox 1 51
e_gw1.8.211.1 Sox 68 136

Links

Other Sox family TFs
Other Fragilariopsis cylindrus TFs

2 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
TSTA_000600 Talaromyces stipitatus TSTA_000600 N
TSTA_002980 Talaromyces stipitatus TSTA_002980 N
TSTA_003830 Talaromyces stipitatus TSTA_003830 N
TSTA_008380 Talaromyces stipitatus TSTA_008380 N
TSTA_009130 Talaromyces stipitatus TSTA_009130 N
TSTA_009440 Talaromyces stipitatus TSTA_009440 N
TSTA_009900 Talaromyces stipitatus TSTA_009900 N
TSTA_022990 Talaromyces stipitatus TSTA_022990 N
TSTA_024630 Talaromyces stipitatus TSTA_024630 N
TSTA_025810 Talaromyces stipitatus TSTA_025810 N
TSTA_029420 Talaromyces stipitatus TSTA_029420 N
TSTA_035660 Talaromyces stipitatus TSTA_035660 N
TSTA_035730 Talaromyces stipitatus TSTA_035730 N
TSTA_050400 Talaromyces stipitatus TSTA_050400 N
TSTA_050560 Talaromyces stipitatus TSTA_050560 N
TSTA_052640 Talaromyces stipitatus TSTA_052640 N
TSTA_055970 Talaromyces stipitatus TSTA_055970 N
TSTA_059810 Talaromyces stipitatus TSTA_059810 N
TSTA_069180 Talaromyces stipitatus TSTA_069180 N
TSTA_080510 Talaromyces stipitatus TSTA_080510 N
TSTA_086330 Talaromyces stipitatus TSTA_086330 N
TSTA_093940 Talaromyces stipitatus TSTA_093940 N
TSTA_096630 Talaromyces stipitatus TSTA_096630 N
TSTA_097820 Talaromyces stipitatus TSTA_097820 N
TSTA_097920 Talaromyces stipitatus TSTA_097920 N
TSTA_098800 Talaromyces stipitatus TSTA_098800 N
TSTA_103240 Talaromyces stipitatus TSTA_103240 N
TSTA_107220 Talaromyces stipitatus TSTA_107220 N
TSTA_109860 Talaromyces stipitatus TSTA_109860 N
TSTA_112350 Talaromyces stipitatus TSTA_112350 N
TSTA_125380 Talaromyces stipitatus TSTA_125380 N
TSTA_125400 Talaromyces stipitatus TSTA_125400 N