CIS-BP Database: Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences
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Ocbimv22001726m.g
(
Octopus bimaculoides
)
C2H2 ZF
TF Information
Pfam ID
Interpro ID
Gene ID
CIS-BP ID
Sequence source
PF00096 (zf-C2H2)
IPR007087
Ocbimv22001726m.g
T140397_2.00
JGI:Metazome (2015-Oct-22)
Directly determined binding motifs
Name/Motif ID
Species
Forward
Reverse
Type/Study/Study ID
SR
Score
DBD
Identity
No direct experiments
Motifs from related TFs
Name/Motif ID
Species
Forward
Reverse
Type/Study/Study ID
SR
Score
DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains
DNA Binding Domains
Protein ID
Domain
From
To
Sequence
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
49
71
IICDVCGKSFVNSSNLTKHKRLH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
77
99
FQCEICGKSLNQKSHLILHKRSH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
105
127
YNCEICGKSFVDKCYLKIHKKMH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
133
155
FNCEICGKKFSHNSRLVVHMRSH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
161
183
FHCDTCGKSFVNNSLLTKHKRIH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
190
212
FDCEICGKSFTESSRLVSHIHSH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
218
240
FHCEVCGQSFVNNGYLTRHKRNH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
246
268
FRCEICGKSFPQNSKLVIHIRSH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
274
296
YHCEICSKSFVHSSNLVTHKRIH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
302
323
YHCEACGRGFVSNSYLTKHKCM
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
330
352
FHCDICGKLFVDRSNLTSHKRIH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
358
380
FHCEVCGKSFRKNSLLVVHIRIH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
386
408
YHCDICGKSFVDKSNLTSHRRIH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
414
436
FHCEVCGKSFWKNSLLVTHIRSH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
442
464
YHCDICGKFFSANSRLLVHKRIH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
470
492
YHCNICGKSFTLNYYLVSHKKVH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
498
520
FHCEICGKTFFNKSHLVSHKRVH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
527
548
HCDICGKYFYSSSNLARHKLLH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
554
576
FRCEICGKTYVNNSDLRRHRRKH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
582
604
FHCEICGKSFFDNSDLIVHIRSH
Ocbimv22001726m.p
C2H2 ZF
610
632
YHCEMCEKSFICKSHLNKHKRTH
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C2H2 ZF
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Octopus bimaculoides
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