CIS-BP Database: Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences
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Ocbimv22019726m.g
(
Octopus bimaculoides
)
C2H2 ZF
TF Information
Pfam ID
Interpro ID
Gene ID
CIS-BP ID
Sequence source
PF00096 (zf-C2H2)
IPR007087
Ocbimv22019726m.g
T141213_2.00
JGI:Metazome (2015-Oct-22)
Directly determined binding motifs
Name/Motif ID
Species
Forward
Reverse
Type/Study/Study ID
SR
Score
DBD
Identity
No direct experiments
Motifs from related TFs
Name/Motif ID
Species
Forward
Reverse
Type/Study/Study ID
SR
Score
DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains
DNA Binding Domains
Protein ID
Domain
From
To
Sequence
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
21
43
FKCNFCDKAFSTASNMREHQRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
49
71
YKCEFCGKTFAQSSTHSKHVQIH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
323
345
YKCTFCNENFVSAEEMEEHIQCH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
351
373
FKCCICYREFNKSFSLLQHIQSH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
613
634
ACMLCPRRFSTASNMREHMRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
640
662
FVCKICHKSFAQSSTHSKHVLTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
668
690
FCCNLCDKTFTRANNYKKHLQKH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
891
913
HRCLYCPRTFSTSGNMKEHMRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
919
941
YECEICHRKFAQSSTHSKHVLTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
947
968
LTCTFCSKSFTHPGPLKYHMFQ
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1404
1426
FKCDYCPRTFSTSSNMKEHTRIH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1432
1454
FKCEYCYRTFAQSSTRAKHLYTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1460
1482
FVCTYCCKTFTDAADLKVHVMTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1693
1715
FRCVFCSRTFSSASNMREHVRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1721
1743
FECKFCHRRFAQSSTHSRHLRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1749
1772
HQCSECGKYFLQLHNLKKHIQVHH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1857
1879
FKCTFCYETFSNAVDFNEHTYLH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
1895
1917
FQCSECDRTFHNSKELENHSKRH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
2109
2131
HKCQFCAKLFSTANNLREHVRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
2137
2160
FSCRICHQRFAQSSTRSKHEKSAH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
2360
2382
HKCNYCNKLFSTRNNLQEHVRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
2388
2411
FKCLVCHRRFAQSSTCSKHMKTTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
3196
3218
HICPFCQKSYSSASNMKEHMRTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
3224
3246
FSCQICLKTFAQKSTLSKHMKTH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
3408
3430
FQCDICCKTFTTSGNLKEHRRIH
Ocbimv22019726m.p
C2H2 ZF
3436
3458
FECPFCSRTFVQASTRSRHVKNH
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