L898_g19012 (Steinernema monticolum)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L898_g19012 T309447_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-232
M00700_2.00 		Caenorhabditis elegans
NNTNTDWYN
NRWHANANN		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10647 		0.765 0.500
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L898_g19012.t1 Nuclear receptor 18 88

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema monticolum TFs

47 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.936
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.913
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.906
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.900
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.899
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.897
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.890
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.887
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.886
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.886
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.880
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.878
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.877
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.873
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.872
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.871
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.869
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.867
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.866
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.843
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.842
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.834
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.833
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.832
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.831
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.827
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.822
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.820
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.816
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.814
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.806
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.805
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.799
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.780
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.779
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.778
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.778
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I 0.771
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.771
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.766
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D 0.765
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.765
L889_g6797 Steinernema feltiae L889_g6797 I 0.763
L898_g4013 Steinernema monticolum L898_g4013 I 0.758
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I 0.749
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.746
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.746