L892_g10842 (Steinernema scapterisci)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L892_g10842 T309160_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-142
M00703_2.00 		Caenorhabditis elegans
RGTCACAR
YTGTGACY		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10714 		0.774 0.557
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L892_g10842.t1 Nuclear receptor 12 82

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema scapterisci TFs

58 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.992
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.982
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.981
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.980
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.979
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.979
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.974
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.973
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.962
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.951
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.944
L892_g14824 Steinernema scapterisci L892_g14824 N 0.937
L892_g14825 Steinernema scapterisci L892_g14825 I 0.936
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.920
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.919
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.899
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I 0.892
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.885
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.884
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.881
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.859
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.858
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.857
L892_g14823 Steinernema scapterisci L892_g14823 N 0.846
L892_g14814 Steinernema scapterisci L892_g14814 N 0.845
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.841
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.841
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.838
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.836
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.832
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.831
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.828
L898_g19021 Steinernema monticolum L898_g19021 I 0.826
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.825
L898_g32142 Steinernema monticolum L898_g32142 N 0.824
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I 0.821
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.818
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.816
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.816
L898_g20180 Steinernema monticolum L898_g20180 I 0.816
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.808
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.800
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.798
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.790
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I 0.789
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I 0.789
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.787
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.784
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.779
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.778
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.776
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D 0.774
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I 0.771
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I 0.771
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I 0.763
L892_g14816 Steinernema scapterisci L892_g14816 N 0.761
NBR_0001834801 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834801 I 0.757
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.753