L893_g27930 (Steinernema glaseri)
Nuclear receptor

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF00105 (zf-C4) IPR001628 L893_g27930 T309359_2.00 WormBase:ParaSite (2015-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
nhr-142
M00703_2.00 		Caenorhabditis elegans
RGTCACAR
YTGTGACY		 PBM
Narasimhan et al.(2015)
pTH10714 		0.781 0.529
For this family, TFs with SR scores > 0.745 will likely have a similar motif

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
L893_g27930.t1 Nuclear receptor 2 72

Links

Other Nuclear receptor family TFs
Other Steinernema glaseri TFs

62 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I 0.955
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I 0.954
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I 0.948
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I 0.930
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I 0.917
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I 0.901
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I 0.898
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I 0.896
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I 0.894
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I 0.892
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I 0.881
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N 0.878
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N 0.877
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I 0.876
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N 0.869
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N 0.867
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I 0.865
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I 0.864
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I 0.863
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I 0.860
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I 0.857
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I 0.855
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I 0.854
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I 0.850
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N 0.849
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I 0.847
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I 0.843
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I 0.840
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I 0.838
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N 0.836
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I 0.832
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I 0.830
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N 0.829
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I 0.824
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I 0.821
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I 0.821
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I 0.815
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I 0.815
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I 0.813
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I 0.812
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I 0.811
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I 0.811
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I 0.801
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I 0.801
ANCCEY_07914 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_07914 I 0.799
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I 0.794
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I 0.794
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I 0.793
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N 0.793
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N 0.793
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I 0.785
NBR_0001834801 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834801 I 0.785
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I 0.785
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I 0.782
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D 0.781
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I 0.779
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N 0.774
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I 0.770
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I 0.764
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N 0.762
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N 0.755
NBR_0001834701 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834701 I 0.753