Cagra.2281s0027 (Capsella grandiflora)
PLATZ

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF04640 (PLATZ) IPR006734 Cagra.2281s0027 T315973_2.00 JGI:Phytozome (2018-Apr-12)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
Cagra.2281s0027.1.p PLATZ 72 143

Links

Other PLATZ family TFs
Other Capsella grandiflora TFs

304 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
nhr-142 Caenorhabditis elegans WBGene00018430 D
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I
L889_g6799 Steinernema feltiae L889_g6799 I
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I
CBG09320 Caenorhabditis briggsae CBG09320 I
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I
L892_g10843 Steinernema scapterisci L892_g10843 I
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I
L892_g2781 Steinernema scapterisci L892_g2781 I
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I
L898_g19019 Steinernema monticolum L898_g19019 I
L898_g21763 Steinernema monticolum L898_g21763 I
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I
L898_g4012 Steinernema monticolum L898_g4012 I
NBR_0001834701 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834701 I
NBR_0001834801 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834801 I
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I
CBN21486 Caenorhabditis brenneri CBN21486 I
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I
ANCCEY_07914 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_07914 I
CRE31070 Caenorhabditis remanei CRE31070 I
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I
HPLM_0000974401 Haemonchus placei HPLM_0000974401 I
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I
L889_g6798 Steinernema feltiae L889_g6798 I
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I
CJA28065 Caenorhabditis japonica CJA28065 I
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I
L889_g6696 Steinernema feltiae L889_g6696 I
CBN28290 Caenorhabditis brenneri CBN28290 I
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I
L898_g4018 Steinernema monticolum L898_g4018 N
L898_g4016 Steinernema monticolum L898_g4016 N
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N
L893_g27943 Steinernema glaseri L893_g27943 N
L898_g2944 Steinernema monticolum L898_g2944 N
L898_g2943 Steinernema monticolum L898_g2943 N
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N
L596_g14578 Steinernema carpocapsae L596_g14578 N
L892_g10840 Steinernema scapterisci L892_g10840 N
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N