CIS-BP Database: Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences
Home
Tools
View cart
Bulk downloads
Database stats
Contact us
Help
Update Log
FAQ
Links
How to cite
CC1G_01421
(
Coprinopsis cinerea
)
ARID/BRIGHT
TF Information
Pfam ID
Interpro ID
Gene ID
CIS-BP ID
Sequence source
Animal TF db
PF01388 (ARID)
IPR001606
CC1G_01421
T014287_2.00
Ensembl (2018-Dec-8)
Link out
Directly determined binding motifs
Name/Motif ID
Species
Forward
Reverse
Type/Study/Study ID
SR
Score
DBD
Identity
No direct experiments
Motifs from related TFs
Name/Motif ID
Species
Forward
Reverse
Type/Study/Study ID
SR
Score
DBD
Identity
NCU01238
M01669_2.00
Neurospora crassa
NYATNNNN
NNNNATRN
PBM
Weirauch et al.(2014)
pTH8942
0.488
0.471
For this family, TFs with SR scores >
0.422
will likely have a similar motif
DNA Binding Domains
Protein ID
Domain
From
To
Sequence
EAU84425
ARID/BRIGHT
230
315
AKLNFLEQLYRFHKQQGNPRVVVPTINHKPLDLWLLRKEVHKMGGYEAVTKGKKWSDLGRTLGYRGIPGLSTQLKNSYTRVILPFE
Links
Other
ARID/BRIGHT
family TFs
Other
Coprinopsis cinerea
TFs
200 Related TFs
Name
Species
Gene ID
Motif Evidence
SR
Score
Action
ANCCEY_07914
Ancylostoma ceylanicum
ANCCEY_07914
I
ANCCEY_13226
Ancylostoma ceylanicum
ANCCEY_13226
I
CBG09567
Caenorhabditis briggsae
CBG09567
I
CBG15881
Caenorhabditis briggsae
CBG15881
I
CRE05044
Caenorhabditis remanei
CRE05044
I
CRE30948
Caenorhabditis remanei
CRE30948
I
HCOI00483700
Haemonchus contortus
HCOI00483700
I
HCOI01190000
Haemonchus contortus
HCOI01190000
I
HPLM_0000277901
Haemonchus placei
HPLM_0000277901
I
HPLM_0000974301
Haemonchus placei
HPLM_0000974301
I
L596_g14532
Steinernema carpocapsae
L596_g14532
I
L596_g14533
Steinernema carpocapsae
L596_g14533
I
L596_g14536
Steinernema carpocapsae
L596_g14536
I
L596_g14537
Steinernema carpocapsae
L596_g14537
I
L596_g14541
Steinernema carpocapsae
L596_g14541
N
L596_g14578
Steinernema carpocapsae
L596_g14578
N
L596_g14588
Steinernema carpocapsae
L596_g14588
I
L596_g14590
Steinernema carpocapsae
L596_g14590
I
L596_g14596
Steinernema carpocapsae
L596_g14596
I
L889_g6692
Steinernema feltiae
L889_g6692
I
L889_g6694
Steinernema feltiae
L889_g6694
I
L889_g6695
Steinernema feltiae
L889_g6695
I
L889_g6792
Steinernema feltiae
L889_g6792
I
L889_g6797
Steinernema feltiae
L889_g6797
I
L889_g6798
Steinernema feltiae
L889_g6798
I
L889_g6799
Steinernema feltiae
L889_g6799
I
L889_g6803
Steinernema feltiae
L889_g6803
N
L889_g6804
Steinernema feltiae
L889_g6804
I
L889_g8185
Steinernema feltiae
L889_g8185
I
L889_g8187
Steinernema feltiae
L889_g8187
I
L892_g10840
Steinernema scapterisci
L892_g10840
N
L892_g10842
Steinernema scapterisci
L892_g10842
I
L892_g10843
Steinernema scapterisci
L892_g10843
I
L892_g14818
Steinernema scapterisci
L892_g14818
I
L892_g14824
Steinernema scapterisci
L892_g14824
N
L892_g14825
Steinernema scapterisci
L892_g14825
I
L892_g2780
Steinernema scapterisci
L892_g2780
I
L892_g2781
Steinernema scapterisci
L892_g2781
I
L892_g2782
Steinernema scapterisci
L892_g2782
I
L893_g18992
Steinernema glaseri
L893_g18992
I
L893_g18993
Steinernema glaseri
L893_g18993
I
L893_g27930
Steinernema glaseri
L893_g27930
I
L893_g27935
Steinernema glaseri
L893_g27935
N
L893_g27943
Steinernema glaseri
L893_g27943
N
L898_g12799
Steinernema monticolum
L898_g12799
I
L898_g19012
Steinernema monticolum
L898_g19012
I
L898_g19014
Steinernema monticolum
L898_g19014
I
L898_g19019
Steinernema monticolum
L898_g19019
I
L898_g19021
Steinernema monticolum
L898_g19021
I
L898_g20180
Steinernema monticolum
L898_g20180
I
L898_g21763
Steinernema monticolum
L898_g21763
I
L898_g2943
Steinernema monticolum
L898_g2943
N
L898_g2944
Steinernema monticolum
L898_g2944
N
L898_g32142
Steinernema monticolum
L898_g32142
N
L898_g3514
Steinernema monticolum
L898_g3514
I
L898_g3515
Steinernema monticolum
L898_g3515
I
L898_g4012
Steinernema monticolum
L898_g4012
I
L898_g4013
Steinernema monticolum
L898_g4013
I
L898_g4015
Steinernema monticolum
L898_g4015
N
L898_g4016
Steinernema monticolum
L898_g4016
N
NBR_0001218401
Nippostrongylus brasiliensis
NBR_0001218401
I
nhr-232
Caenorhabditis elegans
WBGene00012494
D
PEQ_0000560101
Parascaris equorum
PEQ_0000560101
I
PTRK_0001404900
Parastrongyloides trichosuri
PTRK_0001404900
N
scaffold31-EXSNAP2012.20
Pristionchus exspectatus
scaffold31-EXSNAP2012.20
I
SVE_1003800
Strongyloides venezuelensis
SVE_1003800
N
SVUK_0002058501
Strongylus vulgaris
SVUK_0002058501
I