Pavir.Ia02192 (Panicum virgatum)
FAR1

TF Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CIS-BP ID Sequence source
PF03101 (FAR1) IPR004330 Pavir.Ia02192 T181765_2.00 JGI:Phytozome (2018-Apr-12)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related TFs

Name/Motif ID Species Forward Reverse Type/Study/Study ID SR
Score		 DBD
Identity
No TFs with similar DNA binding domains

DNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
Pavir.Ia02192.1.p FAR1 26 112

Links

Other FAR1 family TFs
Other Panicum virgatum TFs

7 Related TFs

Name Species Gene ID Motif Evidence SR
Score		 Action
ACOC_0000492601 Angiostrongylus costaricensis ACOC_0000492601 I
ANCCEY_13226 Ancylostoma ceylanicum ANCCEY_13226 I
CBG06601 Caenorhabditis briggsae CBG06601 I
CBG06611 Caenorhabditis briggsae CBG06611 I
CBG09567 Caenorhabditis briggsae CBG09567 I
CBG14515 Caenorhabditis briggsae CBG14515 I
CBG20727 Caenorhabditis briggsae CBG20727 I
CBG20729 Caenorhabditis briggsae CBG20729 I
CBG22870 Caenorhabditis briggsae CBG22870 I
CBN12210 Caenorhabditis brenneri CBN12210 I
CBN23838 Caenorhabditis brenneri CBN23838 I
CJA02156 Caenorhabditis japonica CJA02156 I
CJA09697 Caenorhabditis japonica CJA09697 I
CRE00301 Caenorhabditis remanei CRE00301 I
CRE08691 Caenorhabditis remanei CRE08691 I
CRE15644 Caenorhabditis remanei CRE15644 I
CRE15675 Caenorhabditis remanei CRE15675 I
CRE18430 Caenorhabditis remanei CRE18430 I
CRE30948 Caenorhabditis remanei CRE30948 I
HCOI00483700 Haemonchus contortus HCOI00483700 I
HCOI01190000 Haemonchus contortus HCOI01190000 I
HPBE_0001646201 Heligmosomoides bakeri HPBE_0001646201 I
HPLM_0000277901 Haemonchus placei HPLM_0000277901 I
HPLM_0000974301 Haemonchus placei HPLM_0000974301 I
L596_g14532 Steinernema carpocapsae L596_g14532 I
L596_g14533 Steinernema carpocapsae L596_g14533 I
L596_g14536 Steinernema carpocapsae L596_g14536 I
L596_g14537 Steinernema carpocapsae L596_g14537 I
L596_g14541 Steinernema carpocapsae L596_g14541 N
L596_g14580 Steinernema carpocapsae L596_g14580 N
L596_g14586 Steinernema carpocapsae L596_g14586 I
L596_g14588 Steinernema carpocapsae L596_g14588 I
L596_g14589 Steinernema carpocapsae L596_g14589 I
L596_g14590 Steinernema carpocapsae L596_g14590 I
L596_g14596 Steinernema carpocapsae L596_g14596 I
L889_g6692 Steinernema feltiae L889_g6692 I
L889_g6694 Steinernema feltiae L889_g6694 I
L889_g6695 Steinernema feltiae L889_g6695 I
L889_g6792 Steinernema feltiae L889_g6792 I
L889_g6803 Steinernema feltiae L889_g6803 N
L889_g6804 Steinernema feltiae L889_g6804 I
L889_g6806 Steinernema feltiae L889_g6806 N
L889_g8185 Steinernema feltiae L889_g8185 I
L889_g8187 Steinernema feltiae L889_g8187 I
L892_g10842 Steinernema scapterisci L892_g10842 I
L892_g14817 Steinernema scapterisci L892_g14817 I
L892_g14818 Steinernema scapterisci L892_g14818 I
L892_g14834 Steinernema scapterisci L892_g14834 N
L892_g2780 Steinernema scapterisci L892_g2780 I
L892_g2782 Steinernema scapterisci L892_g2782 I
L893_g18992 Steinernema glaseri L893_g18992 I
L893_g18993 Steinernema glaseri L893_g18993 I
L893_g27930 Steinernema glaseri L893_g27930 I
L893_g27935 Steinernema glaseri L893_g27935 N
L898_g12798 Steinernema monticolum L898_g12798 I
L898_g12799 Steinernema monticolum L898_g12799 I
L898_g19012 Steinernema monticolum L898_g19012 I
L898_g19014 Steinernema monticolum L898_g19014 I
L898_g3512 Steinernema monticolum L898_g3512 I
L898_g3514 Steinernema monticolum L898_g3514 I
L898_g3515 Steinernema monticolum L898_g3515 I
L898_g4015 Steinernema monticolum L898_g4015 N
NBR_0001218401 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001218401 I
NBR_0001834701 Nippostrongylus brasiliensis NBR_0001834701 I
nhr-170 Caenorhabditis elegans WBGene00008309 I
nhr-178 Caenorhabditis elegans WBGene00017510 I
nhr-213 Caenorhabditis elegans WBGene00011520 I
nhr-231 Caenorhabditis elegans WBGene00012449 I
nhr-232 Caenorhabditis elegans WBGene00012494 D
nhr-45 Caenorhabditis elegans WBGene00003635 I
nhr-54 Caenorhabditis elegans WBGene00003644 I
scaffold31-EXSNAP2012.20 Pristionchus exspectatus scaffold31-EXSNAP2012.20 I
SVUK_0002058501 Strongylus vulgaris SVUK_0002058501 I